| IQB001-Introdução à Bioinformática | Revisão de Biologia Molecular básica. DNA com material genético, estrutura covalente e espacial do material genético. Replicação, transcrição, tradução e diferenças entre procarióticos e eucarióticos. Genes interrompidos e processamento de RNA. Proteínas. O que são, sua função, estrutura, domínios, evolução, alinhamento. O que é DNA recombinante. Como se constrói e o que é uma biblioteca genômica e de c-DNA. Como se faz uma transformação, um PCR, um fingerprinting, um sequenciamento, uma varredura de biblioteca por vários métodos. Array de DNA e seu uso no estudo da expressão gênica. Como se constrói uma biblioteca de c-DNA com o kit com SMART que aumenta os clones completos. Tipos de sequenciador. Uso dos programas Phred-Phrap. Alinhamento global e local. Bases de dados disponíveis como NR, NT, dbEST, Pfam, CDD, signaIP, rRNA, mit-plast, Swiss Prot, etc. Os vários tipos de Blast, seus parâmetros e suas aplicações. Como se sequencia e analisa um genoma. Uso do Phred, do assembler cap3 e de um pacote de programas para gerenciar múltiplos blasts de bibliotecas de CDNA. Como aquilatar o valor de um match. Uso de sites como o VectorBase, TIGR, etc.
BIBLIOGRAFIA BÁSICA
|
|
|